绿肥的肥劲稳、肥效长，单一施用的情况下，往往不能及时满足后茬作物全生育期对养分的需求。绿肥所提供的养分虽然比较全面，但是要满足作物的全部需求，仅仅绿肥的养分是不够的。同时，大多数绿肥作物提供的养分以氮肥为主，因此应考虑到绿肥的腐解特点。

例如在北京地区9月中旬翻压田菁，一个月后，其土壤供氮量出现第一次高峰，为小麦的苗期生长和冬前分蘖提供充足的养分。第二年小麦返青后，需要大量的氮素以便满足其快速生长。此时，虽然田菁的养分释放出现了第二个高峰，但所是风的氮素扔不能保证小麦的正常生长需要。若不供给氮肥，小麦就会出现缺素症状，导致减产。所以，在小麦返青后要及时、适量追施氮肥，才能保证小麦的高产，也才能发挥绿肥的增产潜力。稻田翻压紫云英的研究同样可以看出，紫云英的供肥高峰在水稻的分蘖前期。到了分蘖后期，土壤中铵态氮含量偏低，远远不能满足水稻生殖生长的需要。在水稻分蘖期追施氮肥，可以提供土壤供氮能力，从而保证水稻后期的生长需要，达到高产的目的。

大多数绿肥作物提供的养分以氮为主，所以补充磷钾是十分重要的。但补充磷钾肥最好是在绿肥播种的时基础，这样既可以保证绿肥生长对磷钾的需要，从而提高绿肥的仙草产量和品质，又由于绿肥对磷钾风的吸收和富集而提高磷钾对后茬作物的有效性，达到一箭双雕的目的。